早期的黑糖糕是用小磁碗作模型，直到台灣光復後，才有論斤重的圓形黑糖糕。
由於黑糖糕是屬於發酵糕點，俗稱發糕→發財，所以在民風純樸的澎湖人民深信，在廟宇慶典或重要節日時用黑糖糕來祭拜神民或祖先，可為他們帶來好運及財富。
為什麼一般拿來做祭拜的供品會成為澎湖名產呢？因為澎湖的就業機會少，所以有許多年輕人外流至台灣本島工作，有時就會帶上阿嬤拜拜的黑糖糕請同事吃，久而久之，黑糖糕就成了澎湖名產了。